La obra de Filipa César parte de la observación y la investigación del comportamiento humano. Para ello y partiendo de una particular sensibilidad cinematográfica, hace uso de medios como la fotografía, el vídeo o la instalación. El hecho de que sus obras tengan un fuerte sustrato documental no son un impedimento para el desarrollo de varias capas narrativas en las que surge la ficción.

En el año 2008, su interés por el pasado colonial de Portugal, su país de origen, la lleva a iniciar una serie de películas en las que comienza a cuestionar la capacidad de la disciplina histórica para producir subjetividades, proponiendo otras modos y formatos de conocimiento y de acceso al pasado. El 2011 arranca el proyecto de largo recorrido titulado Luta ca caba inda (La lucha aún no ha terminado), en la que la artista realiza un acercamiento genealógico a los orígenes del cine en Guinea Bissau.